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由于两个系统设定时间时以主板CMOS内的时间为依据，但却有不同的时间计算标准。所以导致了系统时间的纠纷问题。
　　Linux和苹果操作系统以当前主板CMOS内时间做为格林威治标准时间，再根据系统设置的时区来最终确定当前系统时间（如时区设置为GMT+08:00北京时间时以及当前CMOS时间为03:00，那么系统会将两个时间相加得出显示在桌面的当前系统时间为11:00）。
　　Windows 操作系统却直接把CMOS时间认定为当前显示时间，不根据时区转换。这样每调整一次系统时区，系统会根据调整的时区来计算当前时间，确定后，也就同时修改了CMOS内的时间（即每调整一次时区，设置保存后，CMOS时间也将被操作系统改变一次，注意不同操作系统调整时间后，也会同时改变CMOS时间，这一点是共通的）。
　　UTC即Universal Time Coordinated，协调世界时
　　GMT即Greenwich Mean Time，格林尼治平时
　　在这里，你可以把UTC认为是GMT+0。Windows(XP和VISTA)和(Linux/Unix/Mac)缺省看待系统硬件时间的方式是不一样的：
　　* Windows把系统硬件时间当作本地时间(local time)，即操作系统中显示的时间跟BIOS中显示的时间是一样的。
　　* Linux/Unix/Mac把硬件时间当作UTC，操作系统中显示的时间是硬件时间经过换算得来的，比如说北京时间是GMT+8，则系统中显示时间是硬件时间+8。
　　这样，当PC中同时有多系统共存时，就出现了问题。假如你的Linux和WindowsXP中设置的时区都为北京时间东八区，而你在Linux中把当前系统时间更改为9：00AM。则此时硬件中存储的实际是UTC时间1:00AM。这时你重启进入Windows后，你会发现windows系统中显示的时间是1:AM，比Linux中慢了八个小时。同理，你在Windows中更改或用网络同步了系统时间后，再到Linux中去看，系统就会快了8小时。在实行夏令时的地区，情况可能会更复杂些。
　　改windows上的时间后，有时它会自动又改回来。所以，最好在linux下的修改：
　　“系统”－>“管理”—>“时间和日期”—>“时区”，把UTC的勾去掉