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igaph 是一个项目，目标是建立一条简单，易用的网络分析工具，有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现；

项目主页：

http://igraph.org/

在R语言中，对应的就是 igraph 这个R包

安装：

install.packages("igraph")

使用：

对于图 graph 这种数据结构而言，最基本的元素包括节点(node) 和 边(节点之间的连线，edge);

igraph 这个R包提供了很多种创建graph的方式，我们先看一个最基本的例子，从数据框创建一个graph；

我们将要创建的graph 如下：

可以看到，这个graph 包括5个节点，首先创建一个数据框，这个数据框中的每一行是一个节点，每一列是节点的属性

代码如下：

> actors

"Esmeralda"),

age=c(48,33,45,34,21),

gender=c("F","M","F","M","F"))

> actors

name age gender

1 Alice 48 F

2 Bob 33 M

3 Cecil 45 F

4 David 34 M

5 Esmeralda 21 F

actors 这个数据框保存了图中所有节点的信息，共5个节点，有name, age, gender 3种属性；注意节点的属性是自定义的

接下来创建另外一个数据框，保存边的信息，

代码如下：

> relations

+ "David", "Esmeralda"),

+ to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),

+ same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),

+ friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))

> relations

from to same.dept friendship advice

1 Bob Alice FALSE 4 4

2 Cecil Bob FALSE 5 5

3 Cecil Alice TRUE 5 5

4 David Alice FALSE 2 4

5 David Bob FALSE 1 2

6 Esmeralda Alice TRUE 1 3

relations 数据框保存了节点之间的连线信息， from， to 两列描述了这条边是从哪个节点到哪个检点，最后的3列是每条边的一些自定义的属性

当两个数据框创建完成之后，就可以利用 graph_from_data_frame 函数创建一个graph, 代码如下：

g

第一个参数是保存edge 信息的数据框，directed 参数控制graph 有无方向，vertices 参数是保存节点信息的数据框

最后进行一个简单的可视化

plot(p)

就可以得到如下所示的图：

上面只是最基本的可视化的例子，对于graph 而言，有directed graph 和 undirected graph 两种，在可视化的时候，最核心的东西是计算每个节点的位置，对于不同类型的graph， 有不同的自动化的布局算法

参考资料：

https://rdatamining.wordpress.com/2012/05/17/an-example-of-social-network-analysis-with-r-using-package-igraph/